La secuenciación genómica aumenta la precisión en la identificación de parasitoides.

La identificación molecular de parasitoides mediante la secuenciación del genoma completo ha aumentado la precisión en la distinción de especies utilizadas en el control biológico. Un estudio realizado por investigadores brasileños identificó variantes genéticas específicas para cuatro agentes ampliamente utilizados en programas agrícolas: Palmistichus elaeisis, Tetrastichus howardi, Trichospilus diatraeae e Un tricograma precioso.

El estudio utilizó la secuenciación del genoma completo con la plataforma Illumina NovaSeq 6000. Este enfoque permitió la detección de variantes específicas en cada especie. Se identificaron cuatro variantes para Palmistichus elaeisisdos por Tetrastichus howardi, cuatro a Trichospilus diatraeae y cinco por Un tricograma preciosoEstos marcadores permiten una discriminación individual precisa entre especies morfológicamente similares.

Identificación basada en la morfología

La identificación tradicional basada en la morfología presenta limitaciones. Los parasitoides analizados son pequeños y tienen una gran similitud estructural. Esto dificulta el diagnóstico en el campo y requiere conocimientos taxonómicos especializados. El estudio demuestra que las variantes genómicas superan estas limitaciones al proporcionar una diferenciación basada en el ADN.

Los insectos evaluados se utilizan para controlar plagas de lepidópteros de importancia económica. Entre los objetivos, destacan plagas como... Diatraea saccharalis e Thyrintenina arnobiaEstas especies causan daños a cultivos como la caña de azúcar y el eucalipto. La identificación correcta de los parasitoides influye directamente en la eficacia de las liberaciones en el campo.

Herramientas bioinformáticas

El análisis utilizó herramientas bioinformáticas para el control de calidad, la alineación y la detección de variantes. El genoma de referencia Aphelinus certus Tuvo un mejor desempeño. Este material mostró mayor consistencia en la identificación de variantes y una mejor concordancia entre las especies analizadas.

El análisis de componentes principales separó claramente las especies basándose en datos genéticos. El componente principal PC1 explicó el 51,12% de la variación total y aisló Un tricograma precioso de los demás. El análisis de distancia euclidiana confirmó una mayor proximidad genética entre Trichospilus diatraeae e Tetrastichus howardi.

Robustez de los marcadores

El estudio también evaluó la robustez de los marcadores en muestras simuladas. Los resultados indicaron una alta precisión incluso en mezclas con proporciones desequilibradas entre especies. Esta capacidad amplía el uso de la herramienta en situaciones de campo y en biofábricas.

Entre las aplicaciones prácticas se incluye el control de calidad en la producción masiva de parasitoides. Los programas comerciales multiplican estos insectos durante varias generaciones. Este proceso puede reducir la variabilidad genética. El uso de marcadores genómicos permite el monitoreo continuo de las poblaciones.

Este trabajo fue desarrollado por Izabella de Lima Palombo, Fabricio Fagundes Pereira, André Pessoa da Costa, Patrik Luiz Pastori, Alex Polatto Carvalho, Andrea Renata da Silva Romero, André Vieira do Nascimento, Ana Maria Perez Obrien, Patricia Iana Schmidt, Carlos Reinier García Cardoso y Marcelo Teixeira Tavares.

Más información en doi.org/10.3390/insects17040395