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Síntomas de pudrición y rotura de tallos en soja se expanden en la cosecha 2024

Por Flávia Elis de Mello, Sandra Marisa Mathioni, Stephane Pereira de Jesus, Eric Hirata y Douglas Braga Marques

20.02.2025 | 14:58 (UTC -3)

En el estado de Mato Grosso se observaron plantas de soja con síntomas de podredumbre y rotura de tallos, y recientemente este problema se viene expandiendo a otros estados de Brasil. Investigaciones recientes han observado que el hongo diaporthe (pecado. Phomopsis) es el principal patógeno recuperado de plantas sintomáticas. En zonas con alta incidencia, las estructuras reproductivas del hongo se pueden observar en los tejidos externos de los tallos (Figura 1A, 1B y 1C). Dependiendo de la susceptibilidad de las variedades de soja y de las condiciones climáticas favorables para el desarrollo del patógeno, en los casos más severos el síntoma característico es el rompimiento de los tallos, que ocurre aproximadamente a 5 a 10 cm del suelo (Figura 1D y 1E).

Trabajos publicados en otros países productores de soja han reportado, por ejemplo, la ocurrencia de varias especies de diaporthe aislado de síntomas de podredumbre en vainas y granos. El crecimiento micelial de estas especies es morfológicamente muy similar entre sí y hace imposible la identificación correcta de las especies. Sin embargo, es importante identificar correctamente las especies de Diaporthe que pueden estar causando los síntomas de podredumbre y rotura del tallo en la soja.

El objetivo de esta investigación fue identificar, mediante el uso de herramientas de biología molecular, como la secuenciación de ADN, las especies de Diaporthe spp. predominante en plantas de soja que presentan síntomas de podredumbre y rotura del tallo.

Figura 1 – Plantas de soja utilizadas en esta investigación que mostraron síntomas de rotura del tallo. A) y B) La planta fue muestreada en la ciudad de Ubiratã (PR), en noviembre de 2023. C) Tallos de soja con estructuras de picnidios fúngicos que fueron identificados como D. longicolla, en una muestra colectada en la ciudad de Vargeão (SC), en enero de 2024. D) y E) Tallos de plantas de soja sintomáticas colectadas en las ciudades de Passo Fundo y Erebango, respectivamente, en Rio Grande do Sul; Ambas muestras fueron recolectadas en enero de 2024. — **Figura 1 -** Plantas de soja utilizadas en esta investigación que mostraron síntomas de rotura del tallo. A) y B) La planta fue muestreada en la ciudad de Ubiratã (PR), en noviembre de 2023. C) Tallos de soja con estructuras de picnidios fúngicos que fueron identificados como D. longicolla, en una muestra colectada en la ciudad de Vargeão (SC), en enero de 2024. D) y E) Tallos de plantas de soja sintomáticas colectadas en las ciudades de Passo Fundo y Erebango, respectivamente, en Rio Grande do Sul; Ambas muestras fueron recolectadas en enero de 2024.

Metodología utilizada

Se recolectaron plantas sintomáticas en los estados de Rio Grande do Sul, Santa Catarina y Paraná, durante la cosecha de 2024. Se recolectaron más de 50 muestras de plantas de soja en áreas comerciales y se analizaron en laboratorio. De estas muestras se aislaron 90 diaporthe spp.

El hongo fue aislado directamente, a través de la identificación de las estructuras presentes en sus tallos. Estas estructuras fueron transferidas al medio de cultivo PDA (agar papa dextrosa) y mantenidas a una temperatura de 24°C ± 2°C, en un fotoperiodo de 12 horas.

Luego del aislamiento y purificación de los aislados, el crecimiento micelial de cada aislado fue transferido individualmente a un microtubo para la extracción de ADN y análisis de la secuencia de ADN e identificación de especies, utilizando algunas regiones del genoma (ITS, TUB2 y EF1-α).

Se analizaron los electroferogramas (ejemplo en la Figura 2) y se generaron secuencias de consenso que se utilizaron en análisis de similitud con secuencias de especies conocidas y disponibles públicamente.

Figura 2 - Electroferograma de la secuencia parcial del gen del factor de elongación (EF1-α), utilizado en el análisis de identificación de especies de Diaporthe. En la imagen se encuentran alineadas las secuencias de una muestra de D. ueckeri y otra de D. longicolla. Los diferentes nucleótidos entre las dos especies están resaltados en rectángulos e indicados por flechas. La secuencia de referencia utilizada para la alineación es de D. ueckeri — **Figura 2 -** Electroferograma de la secuencia parcial del gen del factor de elongación (EF1-α), utilizado en el análisis de identificación de especies de Diaporthe. En la imagen se encuentran alineadas las secuencias de una muestra de D. ueckeri y otra de D. longicolla. Los diferentes nucleótidos entre las dos especies están resaltados en rectángulos e indicados por flechas. La secuencia de referencia utilizada para la alineación es de D. ueckeri

Resultados obtenidos

las especies D. ueckeri e D. longicolla son los dos que se asocian con los síntomas de rotura del tallo en plantas de soja sintomáticas. De los 90 aislamientos analizados y originarios de los tres estados, 38 (42,2%) fueron identificados como D. ueckeri y 52 (57,8%) como D. longicolla, mostrando un predominio de esta especie en la región Sur.

Comparativamente, en otro estudio con muestras recolectadas en el Cerrado, más específicamente en Mato Grosso, de 68 aislamientos recuperados, 50 fueron identificados como D. ueckeri, mostrando así un predominio de esta especie en el Cerrado. Diferencias en las secuencias de ADN de dos muestras, una de D. ueckeri y otro D. longicolla, se destacan en la Figura 2.

Ambas especies recuperadas están ampliamente distribuidas en todos los estados muestreados, Paraná, Santa Catarina y Rio Grande do Sul (Figura 3). Sin embargo, de los 30 aislamientos analizados de muestras de Rio Grande do Sul, 27 fueron identificados como D. longicolla.

De los 90 aislamientos analizados, ninguno de ellos fue identificado como D. caulivora ou D. aspalathi, lo que demuestra que los cultivares actualmente plantados aún presentan resistencia a estas dos especies, principalmente D. aspalathi.

Figura 3 - Distribución geográfica y ubicación de los 90 aislamientos de D. ueckeri y D. longicolla recuperados de plantas de soja que mostraron síntomas de rotura del tallo. De los 90 aislamientos, 54 son del estado de Paraná, seis de Santa Catarina y 30 de Rio Grande do Sul. Los colores en el mapa representan los aislamientos identificados molecularmente como D. ueckeri (azul) y D. longicolla (verde). — **Figura 3 -** Distribución geográfica y ubicación de los 90 aislamientos de D. ueckeri y D. longicolla recuperados de plantas de soja que mostraron síntomas de rotura del tallo. De los 90 aislamientos, 54 son del estado de Paraná, seis de Santa Catarina y 30 de Rio Grande do Sul. Los colores en el mapa representan los aislamientos identificados molecularmente como D. ueckeri (azul) y D. longicolla (verde).

Diagnóstico correcto

La correcta identificación de patógenos asociados a síntomas de podredumbre y rotura del tallo se ha convertido en un nuevo desafío desde las cosechas 2019/2020 en Brasil. Un diagnóstico correcto, mediante la combinación de análisis morfológicos de las estructuras del patógeno y el uso de herramientas de biología molecular, es fundamental para ayudar al manejo adecuado de los patógenos y mitigar los daños que se han observado en las últimas cosechas. Principalmente porque, en este momento, el comportamiento genético de los cultivares comerciales respecto a la resistencia a D. ueckeri e D. longicolla.

Hasta que se identifiquen las fuentes de genes de resistencia y se desarrollen cultivares con un cierto nivel de resistencia, otras herramientas de gestión, como la rotación de cultivos no hospedantes y la aplicación de fungicidas, son esenciales para mitigar daños futuros.

Consideraciones finales

En esta investigación, observamos que, durante la cosecha de 2024, la especie D. ueckeri e D. longicolla predominaron en las áreas muestreadas en la región Sur. Con este resultado, junto con los obtenidos en estudios anteriores que observaron las dos especies en el Cerrado, se observa que están distribuidas en todas las regiones productoras de soja de Brasil. Además, no se aislaron D. aspalathi e D. caulivora de plantas sintomáticas, mostrando la aparición de D. ueckeri e D. longicolla en vainas y tallos de soja.

por Flávia Elis de Mello, Sandra Marisa Mathioni, Stéphane Pereira de Jesús, Eric Hirata e Douglas Braga Marques (Syngenta Protección de Cultivos Ltd.)